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进入9月份以后，早熟品种基本完成采收工作，中熟和晚熟品种陆续进入收获季节。随着天气转凉，病虫害发生相对放缓。但秋季仍是各种叶部和果实病害的高发期，防治不及时会形成严重危害。秋季需重点防控褐斑病、炭疽叶枯病、黑星病、炭疽病、果实黑红点病、褐腐病、锈果病、煤污病、顶梢卷叶蛾、金纹细蛾、苹小卷叶蛾和苹果绵蚜。
一、秋季发生严重的病虫害
1、病害
枝干病害：包括腐烂病和轮纹病，腐烂病在秋季处于全年的第二个发生高峰，如果夏季通过增施钾肥能够对这一病害起到一定控制效果。枝干轮纹病在树上造成病瘤和粗皮，病组织上产生的病原菌分生孢子能够通过风雨传播侵染果实，秋季也是防控轮纹病的重要时段。
褐斑病：8月上旬，当果园内褐斑病的病叶率达到或超过3%，遇使叶面湿润超过24小时的降雨，雨前或雨后需喷施杀菌剂防治褐斑病，或者每遇到3-5个降雨日加喷一次杀菌剂，直到9月底。雨前可以喷施保护性杀菌剂，如代森锰锌、铜制剂、克菌丹等，雨后需喷三唑类杀菌剂，如戊唑醇、丙环唑等。
炭疽叶枯病：对于8月份或9月初采收的中早熟感病品种，如嘎啦、金冠等，于果实采收后，全园喷布一遍波尔多液或其他保护性杀菌。对晚熟的感病品种，如明月，需关注气象预报，在每次预报的降雨前，喷施保护性杀菌剂，如代森锰锌、铜制剂、克菌丹等，保护叶片和果实在降雨中不被病菌侵染。
苹果黑星病：对于6-7月份发生过黑星病的果园，无论轻重，都需在9月中旬前后喷布一遍内吸治疗性杀菌剂，如氟哇硅、嘧霉胺、苯醚甲环唑等，以减少果园内黑星病的病叶量，降低后期病菌侵染果实的概率。
苹果炭疽病（苦腐病）：又名苹果苦腐病，在生长期危害苹果果实并产生腐烂症状，也可造成采后腐烂。夏季高温，多雨，潮湿的地区尤为严重。幼果期果实即可被侵染，近成熟时才开始发病，采收后在贮藏期继续发生，导致采前的大量落果和贮藏期的果实腐烂。果实发病初期呈现针头大小的褐色圆形斑，边缘清晰，病斑随后迅速扩大，呈圆锥形深入果肉，横断面呈现‘V’形，是苦腐病的典型特征。
果实黑红点病：苹果红黑点病主要是出现在套袋苹果上的一种病害。是果实感染粉红聚端孢霉菌危害所致。一般发生在每年的七八月份，但一般在解袋后才被发现，与高温高湿的天气有很大的关系。
煤污病：苹果煤污病是一类世界范围内广泛发生的真菌病害，在我国各苹果产区普遍发生。苹果煤污病的症状类型非常多样，主要包括：蝇粪型点状、紧凑型点状、离散型点状、分支状、蜂巢状、微粒状、刻点状、煤烟状等。煤污病可在寄主表面蜡质层形成黑褐色的污斑或污点，但不侵染内部组织。煤污病不直接引起苹果产量损失，但影响果实外观品质，降低其商品价值。苹果套袋可有效预防煤污病的发生。
褐腐病：褐腐病是常见苹果果实病害，在世界各地广泛分布。褐腐病可引起花腐、叶片枯萎、枝干溃疡甚至流胶，并造成果实腐烂。果实受侵染后，初期出现浅褐色小斑，病斑迅速扩展，果实发病部分变褐，果肉松软，发病10天左右可造成整果腐烂。遇到多雨潮湿的天气，其腐烂果肉的表皮会形成很多突起的灰褐色或灰白色绒球状物。树上的病果少量残留于树上，失水干缩成僵果；发病果实也可提早脱落，或埋藏在土壤和落叶下面。
苹果锈果病：一般认为有三种症状类型，锈果型、花脸型和混合型。锈果型：从萼洼处开始，向梗洼方向呈放射状产生锈色条纹，该条纹由表皮细胞木栓化形成，多不规则但多与心室相对应。严重病果，果面龟裂，果实畸形，果肉僵硬，失去食用价值。花脸型：病果着色前一般没有明显症状，着色后散生许多不着色的近圆形黄绿色斑块，使果实呈红绿相间的“花脸”状。病果不着色部分稍凹陷，果面略显凹凸不平。混合型：病果着色前，在萼洼附近产生锈色斑块；着色后，在没有锈斑的地方或锈斑周围产生不着色的斑块而呈“花脸”状。针对锈果病尚无有效控制方法，建议发现病树用油漆进行标记，待冬季或早春刨除发病果树或高接‘金冠’等耐病品种。
2、虫害
顶梢卷叶蛾：1年发生2-3代，以2-3龄幼虫在枝梢顶端卷叶团中越冬。第2代成虫发生于7月下旬-8月末。
金纹细蛾：1年发生4-5代，以冬型成虫在落叶、杂草中越冬。第三代在8月中旬。幼虫在新梢叶片上表皮下取食叶肉，造成下表皮与叶肉分离，叶背面形成一皱褶，叶正面虫斑呈透明网眼状。
苹小卷叶蛾：1年发生3-4代，以初龄幼虫潜伏在剪口、锯口、树杈的缝隙中、老树皮下做白色薄茧越冬。尤其在剪锯口，越冬幼虫数量居多。
苹果绵蚜：苹果绵蚜以1～2龄若虫在枝干伤疤、裂缝处及地表根基部越冬。9月中旬以后，寄生蜂数量逐渐减少，绵蚜数量又逐渐增加，绵蚜发生数量出现第2次高峰。
二、管理措施
1、农业防治
（1）科学追施肥料。注重增施沼肥及其它有机肥，增强果树抗病能力；适时灌溉或排水控制果园湿度；合理修剪，防止果园密闭；及时中耕除草。
（2）清除病虫残体。及时剪除白粉病梢和卷叶蛾虫苞；刮除老
皮、翘皮，消灭部分越冬幼虫；剪除绵蚜危害的枝条；摘除炭疽、
轮纹病果及未脱果的食心虫果。秋季果树落叶后，清扫落叶，集中烧毁，或进行秋翻地，将落叶埋入土中，以消灭越冬虫蛹和病叶，减少来年的病虫基数。
（3）深翻土壤。果实采摘后至11月上旬，有条件的果园结合深翻施肥将树盘范围内10厘米厚的表土填入深30厘米的施肥沟底层，将底土盖在上面，可以消灭表土中越冬的桃小食心虫、草履蚧、康氏粉蚧和山楂叶螨等。
（4）科学摘袋。使用双层纸袋的果园，摘袋时建议先摘除外层纸袋，过两三天后再摘除内层蜡纸袋，以保证果实表光并预防病虫害侵染。
2、生物防治
（1）根施菌肥。随秋施肥增施微生物菌肥，增加根系土壤中有益菌数量，控制根部病害的发生；增强树势，对于控制腐烂病和枝干轮纹病也具有较好效果。
（2）释放天敌。不再喷施化学农药的果园，此时可以通过释放赤眼蜂、金纹细蛾跳小蜂、金纹细蛾姬小蜂等寄生蜂控制害虫危害；
（3）喷施生防病毒或生防菌剂。喷施苹小卷叶蛾颗粒体病毒（APGV）防治苹小卷叶蛾幼虫，喷施苏云金芽孢杆菌菌剂防治鳞翅目害虫等；喷施枯草芽胞杆菌等微生物菌剂防治叶果类病害。
3、科学用药
9月份以后苹果进入采收季节，对于前期防治较好的果园，如果园病虫基数低于1%，这一阶段可以不再喷施化学农药。对于前期发病较重，存在早期落叶、落果等重大损失风险的果园，还需要根据果园实际情况适时喷施药剂对病虫害进行防控。对于苹果树腐烂病，应在果园管理过程中及时巡查，发现病斑及时刮治处理。
9月上中旬，针对炭疽叶枯病、早期落叶病和轮纹病等病害的发生，可以再喷施一次化学药剂，可以选用的杀菌剂包括戊唑醇、氟硅唑、苯醚甲环唑、吡唑醚菌酯等，杀虫剂可以选用高效氯氰菊酯、灭幼脲、吡虫啉等，喷药时可以加入磷酸二氢钾1000倍以利于果实转色。所选用的杀虫杀菌剂尽量选用不刺激果面的水剂、悬浮剂等剂型，尽量避免使用乳油、粉剂等剂型。
10月底到11月初，通过喷施三遍尿素，可以使叶片营养尽快回流到枝干中，提升枝干营养充实度，利于果树越冬；并能提升芽饱满度，利于来年开花座果。具体措施：第一遍尿素，浓度3～5%，7天后喷第二次，浓度为6～8%,14天后喷第三，浓度为8%～10%，第一次喷施尿素时还可加硫酸锌和少量硼砂。